Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NXF1Q9UBU9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NXF1Q9UBU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms