Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2U7

SLC17A7, Vesicular glutamate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC17A7Q9P2U7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC17A7Q9P2U7 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC17A7Q9P2U7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms