Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HCN3Q9P1Z3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HCN3Q9P1Z3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms