Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NCKIPSDQ9NZQ3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NCKIPSDQ9NZQ3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms