Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DNAJC28Q9NX36 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DNAJC28Q9NX36 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms