Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVE4

CCDC87, Coiled-coil domain-containing protein 87, humanhuman

Predictions only

Length 849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC87Q9NVE4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CCDC87Q9NVE4 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCDC87Q9NVE4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC87Q9NVE4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms