Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD3

SETD4, SET domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD4Q9NVD3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SETD4Q9NVD3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SETD4Q9NVD3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms