Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX7

RNF146, E3 ubiquitin-protein ligase RNF146, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF146Q9NTX7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RNF146Q9NTX7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RNF146Q9NTX7 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms