Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.82■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
PDS5BQ9NTI5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PDS5BQ9NTI5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PDS5BQ9NTI5 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms