Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EMILIN3Q9NT22 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EMILIN3Q9NT22 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms