Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
RRP7BPQ9NSQ0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
RRP7BPQ9NSQ0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms