Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
LTBP3Q9NS15 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
LTBP3Q9NS15 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
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