Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC31BQ9NQW1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SEC31BQ9NQW1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SEC31BQ9NQW1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms