Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RTN4Q9NQC3 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RTN4Q9NQC3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms