Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ79

CRTAC1, Cartilage acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRTAC1Q9NQ79 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRTAC1Q9NQ79 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRTAC1Q9NQ79 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms