Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ARFGAP3Q9NP61 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARFGAP3Q9NP61 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARFGAP3Q9NP61 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 316.1 ms