Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CD248Q9HCU0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD248Q9HCU0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms