Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBX8

LGR6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR6Q9HBX8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
LGR6Q9HBX8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
LGR6Q9HBX8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LGR6Q9HBX8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms