Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7B4

SMYD3, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD3Q9H7B4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SMYD3Q9H7B4 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SMYD3Q9H7B4 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms