Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6L5

RETREG1, Reticulophagy regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETREG1Q9H6L5 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
RETREG1Q9H6L5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RETREG1Q9H6L5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms