Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2U6

LINC00597, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00597, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00597Q9H2U6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LINC00597Q9H2U6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LINC00597Q9H2U6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms