Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2L5

RASSF4, Ras association domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF4Q9H2L5 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RASSF4Q9H2L5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RASSF4Q9H2L5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms