Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2C0

GAN, Gigaxonin, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GANQ9H2C0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GANQ9H2C0 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GANQ9H2C0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms