Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W8

SMG9, Protein SMG9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG9Q9H0W8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SMG9Q9H0W8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SMG9Q9H0W8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms