Protein–RNA interactions for Protein: Q9H000

MKRN2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN2Q9H000 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MKRN2Q9H000 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
MKRN2Q9H000 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MKRN2Q9H000 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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