Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
POLR1EQ9GZS1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
POLR1EQ9GZS1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms