Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SMIM3Q9BZL3 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SMIM3Q9BZL3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms