Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXB7

SPATA16, Spermatogenesis-associated protein 16, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA16Q9BXB7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SPATA16Q9BXB7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SPATA16Q9BXB7 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms