Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVX2

TMEM106C, Transmembrane protein 106C, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106CQ9BVX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM106CQ9BVX2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM106CQ9BVX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms