Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV99

LRRC61, Leucine-rich repeat-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC61Q9BV99 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
LRRC61Q9BV99 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LRRC61Q9BV99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms