Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
TRAF4Q9BUZ4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAF4Q9BUZ4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1235.1 ms