Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
RSG1Q9BU20 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
RSG1Q9BU20 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms