Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CPPED1Q9BRF8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms