Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
RETNLBQ9BQ08 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RETNLBQ9BQ08 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms