Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOL4Q9BPW4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOL4Q9BPW4 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms