Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VAT1Q99536 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
VAT1Q99536 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms