Protein–RNA interactions for Protein: Q96SQ7

ATOH8, Protein atonal homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH8Q96SQ7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATOH8Q96SQ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATOH8Q96SQ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms