Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ALS2Q96Q42 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ALS2Q96Q42 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ALS2Q96Q42 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms