Protein–RNA interactions for Protein: Q96P47

AGAP3, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP3Q96P47 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AGAP3Q96P47 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AGAP3Q96P47 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms