Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
SCLT1Q96NL6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SCLT1Q96NL6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms