Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
NSMCE2Q96MF7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NSMCE2Q96MF7 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms