Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00615Q96LM1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00615Q96LM1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms