Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CDK5RAP3Q96JB5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CDK5RAP3Q96JB5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms