Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ZC2HC1AQ96GY0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ZC2HC1AQ96GY0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms