Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE7

PIK3IP1, Phosphoinositide-3-kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3IP1Q96FE7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PIK3IP1Q96FE7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PIK3IP1Q96FE7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms