Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
DDX11Q96FC9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
DDX11Q96FC9 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms