Protein–RNA interactions for Protein: Q969Y2

GTPBP3, tRNA modification GTPase GTPBP3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP3Q969Y2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GTPBP3Q969Y2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms