Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
PRG4Q92954 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
PRG4Q92954 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC35.05■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
PRG4Q92954 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 157.9 ms