Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDY2

RB1CC1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RB1CC1Q8TDY2 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC42.49■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC42.47■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC42.46■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.39
RB1CC1Q8TDY2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC42.44■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC42.41■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC42.4■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
RB1CC1Q8TDY2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC42.38■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC42.34■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC42.33■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC42.32■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC42.32■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
RB1CC1Q8TDY2 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.31■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
RB1CC1Q8TDY2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms