Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG2

ACTRT1, Actin-related protein T1, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT1Q8TDG2 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ACTRT1Q8TDG2 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ACTRT1Q8TDG2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms